由非root用户安装python包/工具
发布时间:2020-12-30 20:41:58 所属栏目:Linux 来源:互联网
导读:(1)我必须安装一个 python包(HTSeq),但我没有root权限. 该软件包需要python 2.4或最新版本.我们的集群上有python 2.3. 因此我在我的一个本地目录上安装了python 2.7 运用 ./configure --prefix=/home/amit/tools/localpython make make install (2)该软件包还
(1)我必须安装一个 python包(HTSeq),但我没有root权限. 该软件包需要python 2.4或最新版本.我们的集群上有python 2.3. 因此我在我的一个本地目录上安装了python 2.7 ./configure --prefix=/home/amit/tools/localpython make make install (2)该软件包还需要numpy:所以我也使用以下方法将它安装在我的本地目录中: /home/amit/tools/localpython/bin/python2.7 setup.py install --home=/home/amit/tools/localnumpy 并做了 >>> sys.path.append("/home/amit/tools/localnumpy/lib/") (3)我下载了HTSeq的tar文件(我想下载)并运行 /home/amit/tools/localpython/bin/python2.7 setup.py install --home=/home/amit/tools/localhtseq 它抛出以下错误: Could not import 'setuptools',falling back to 'distutils'. Setup script for HTSeq: Failed to import 'numpy'. Please install numpy and then try again to install HTSeq. 请告诉我如何克服它的一些提示 提前致谢 解决方法Setuptools是安装该软件包所需的另一项要求.一种选择是使用virtualenv来创建一个包含的python环境.这可以在任何地方进行,并由创建它的用户拥有. 要在没有管理员权限的情况下安装virtualenv(从this answer开始): 下载最新版virtualenv的tar.gz. wget http://pypi.python.org/packages/source/v/virtualenv/virtualenv-1.7.1.2.tar.gz tar -xzf virtualenv-1.7.1.2.tar.gz /home/amit/tools/localpython/bin/python2.7 virtualenv-1.7.1.2/virtualenv.py env env/bin/pip install HTSeq env/bin/pip install numpy 现在使用虚拟环境中的python二进制文件运行脚本: env/bin/python myscript.py (编辑:阜阳站长网) 【声明】本站内容均来自网络,其相关言论仅代表作者个人观点,不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利,请及时与联系站长删除相关内容! |